검은점뿌리썩음병은 곰팡이에 의해 발생되는 병으로 전염은 수박, 메론 등의 주요 박과채소의 뿌리병반으로부터 성숙된 자낭각에서 자낭포자를 방출하면서 시작되고, 이듬해 수박, 메론을 이어짓기하면 흙속에 묻혀 있던 자낭포자가 기주로 침입하여 병이 발생된다. 또한 종자전염에 의해 발생되기도 하며, 이 균은 30℃이상의 고온에서 잘 자라며 생육온도범위도 6~37℃로 매우 넓다.

방제대책으로는 균의 토양 내 생존기간이 길고 박과작물의 피해가 우려되므로 병이 발생한 포장에서의 연작을 피하는 것이 제일 좋은 방법이라 할 수 있다.

화학적 방제법으로는 피씨엔비 등 많은 화학 농약이 실험되어 졌으나 토양훈증제인 메칠부로마이드, 클로로피크린 및 다조멧트 분제를 제외하고는 방제가가 충분치 않은 것으로 알려져 있다.

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