식물의 씨가 싹이 트려면 물, 온도, 산소 등의 조건이 맞아야 하고 빛이 있어야만 싹이 트는 경우 또는 빛이 없어야만 싹이 트는 경우도 있다. 그렇다면 과일의 씨는 왜 과일 속에서는 싹이 트지 않는 것일까 물, 온도, 산소라는 조건을 생각해보면 충분히 과일 속에서도 씨는 싹이 틀 수 있을 것으로도 보인다. 답이 간단하지는 않지만 먼저 과일 속에 산소가 충분히 있다고 볼 수는 없다. 과일 자체도 호흡을 계속하고 있기 때문에 과일 속에 들어있는 씨앗이 충분한 산소를 받기 어려울 수도 있다. 온도 조건도 따뜻한 온도가 계속 유지된다고 해서 싹이 트는 것이 아니라, 감이나 포도 등의 씨앗은 얼마 동안 낮은 온도에 있어야만 싹이 나올 수 있다. 또, 과실 자체에 식물의 호흡에 지장을 주는 물질이 들어있는 경우도 있다. 대표적으로 어린 매실에는 청산이 많이 들어있는데 이것이 호흡에 지장을 주어 발아를 막는다. 이렇게 발아를 막는 물질은 여러 가지가 알려져 있다.