서해어업지도사무소 사무실은 전남 목포에 소재하고 있으며, 서해상 어선 안전조업지도, 불법어업 지도단속업무 및 국가어항 건설업무를 맡고있는 농림수산식품부 1차소속기관입니다.

어항건설업무는 경기도에서부터 전남지역까지 관할하고 있으며 토목직(시설직)은 공무원 임용시 국가어항 건설업무를 맡게됩니다. 어항건설업무를 원활히하기 위하여 인천에 사무소를 두고 있으며 목포(본소)와 업무를 분담하여 처리하고 있습니다.

외지 근무자가많아 숙소를 다량  확보하고 있으며, 업무는 그리 과중하지만은 않습니다.