종자보증은 종자가 증식되는 동안 다양한 종자의 품질을 조사하고 보장하는 체계이다 신품종 육성시 육종가는 소량의 종자만 가지고 있으므로 이를 증식해야한다. 증식 후에 품종의 특성이 변하지 않았고 불순물이 없으며, 높은 발아력을 가지고 있음을 확인하는 것이 중요한다. OECD보증은 품종의 순도만을 보증하나 우리나라는 품종의 순도 외에 종자순도, 이종종자 혼입, 발아, 종자병해, 수분함량 등 다른 성능도 검사한다.